RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-207ENST00000484547 LIASO43766 372 aa11.21□□□□□ -0.61
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RABGEF1-207ENST00000484547 LINGO3P0C6S8 592 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 ACPPP15309 386 aa11.21□□□□□ -0.61
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RABGEF1-207ENST00000484547 IL17FQ96PD4 163 aa11.21□□□□□ -0.61
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RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.2□□□□□ -0.62
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RABGEF1-207ENST00000484547 MENTQ9BUN1 341 aa11.2□□□□□ -0.62
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RABGEF1-207ENST00000484547 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST11Q9NPF2 352 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 MKS1Q9NXB0 559 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 C3orf18Q9UK00 162 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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