RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	EXT2	Q93063	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	APOA4	P06727	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NFATC2	Q13469	925 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MTF1	Q14872	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	OPCML	Q14982	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TAB1	Q15750	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PTGIS	Q16647	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FZD8	Q9H461	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FN3K	Q9H479	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SOCS3	O14543	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CEACAM4	O75871	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	BAG3	O95817	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CETN2	P41208	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SOX3	P41225	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	OR3A2	P47893	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	RGS19	P49795	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM50B	P56557	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	EGFL8	Q99944	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	KANK1	Q14678	1352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230		H7C0S8	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CCDC188	H7C350	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CCL24	O00175	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	IDH3B	O43837	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	LMO4	P61968	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	IRX4	P78413	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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