RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 LRRK2Q5S007 2527 aa22.18■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 SLC6A12P48065 614 aa22.17■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.17■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.17■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 CXCR2P25025 360 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 SLC12A2P55011 1212 aa22.16■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.16■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.16■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 COL12A1Q99715 3063 aa22.15■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 IL1RNP18510 177 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-215ENST00000478473 ATP6V0D1P61421 351 aa22.15■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.15■■□□□ 1.14
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C9orf3-215ENST00000478473 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 MOCOSQ96EN8 888 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 OR1F2PQ96R84 312 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 CYTH2Q99418 400 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.14■■□□□ 1.13
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