RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 SCAMP1O15126 338 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 YY2O15391 372 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PRMT3O60678 531 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 OR4F21O95013 312 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 MT-CO3P00414 261 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 NPPAP01160 153 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 MPSTP25325 297 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SERPINB3P29508 390 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 AHRP35869 848 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 EPHA4P54764 986 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ERVK-8P63133 956 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 BTKQ06187 659 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 BNIP1Q12981 228 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TRAF3Q13114 568 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PRKG2Q13237 762 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 DOC2AQ14183 400 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SQLEQ14534 574 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 HERC3Q15034 1050 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CGB2Q6NT52 195 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 OOSP2Q86WS3 158 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 NRROSQ86YC3 692 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 DDIASQ8IXT1 998 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 LAS2Q8IYD9 372 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TRPV3Q8NET8 790 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 LMX1AQ8TE12 382 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ESAMQ96AP7 390 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 RAB33BQ9H082 229 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf21Q9H246 121 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 RHBGQ9H310 441 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf109Q9NX04 203 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ASIC5Q9NY37 505 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TRBC2A0A5B9 178 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 LILRA5A6NI73 299 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ISM1B1AKI9 464 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SDHDO14521 159 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 FCHO1O14526 889 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 GUCY1B2O75343 617 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SEC22BO75396 215 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 CLEC3AO75596 197 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SEMA3DO95025 777 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 AMD1P17707 334 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 EPHA3P29320 983 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 PKLRP30613 574 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 ASMTP46597 345 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 BDKRB1P46663 353 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 TBPL1P62380 186 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 GPLD1P80108 840 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 HHEXQ03014 270 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-207ENST00000475558 SQSTM1Q13501 440 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms