RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613	EDEM2	Q9BV94	578 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	NUF2	Q9BZD4	464 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	BTRC	Q9Y297	605 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CEP250	Q9BV73	2442 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	GSAP	A4D1B5	854 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ISM1	B1AKI9	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613		H3BMH7	237 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SLC28A1	O00337	649 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	NDUFAB1	O14561	156 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HAT1	O14929	419 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	DUX1	O43812	170 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	NRP2	O60462	931 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CTSV	O60911	334 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CLEC3A	O75596	197 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CHEK2	O96017	543 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	KIT	P10721	976 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TYRP1	P17643	537 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	AMD1	P17707	334 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MAG	P20916	626 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SERPINB3	P29508	390 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HMOX2	P30519	316 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	BCL6	P41182	706 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ARFIP2	P53365	341 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	GFER	P55789	205 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	OR1D5	P58170	312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HYAL2	Q12891	473 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	IFT88	Q13099	833 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ILK	Q13418	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CUL3	Q13618	768 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MANEA	Q5SRI9	462 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	GLRX5	Q86SX6	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	KMT5C	Q86Y97	462 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	OR10G6	Q8NH81	332 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	WDR48	Q8TAF3	677 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	NT5C	Q8TCD5	201 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	AGR3	Q8TD06	166 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	PPM1M	Q96MI6	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	OR52B2	Q96RD2	323 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MS4A8	Q9BY19	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ACPT	Q9BZG2	426 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	AICDA	Q9GZX7	198 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBP1-208	ENST00000467613	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms