RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466681.1

MALSU1-202, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MALSU1, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-202ENST00000466681 FAM129BQ96TA1 746 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 WWOXQ9NZC7 414 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF222Q9UK12 451 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 J3KTA2 159 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 TSPAN12O95859 305 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 PSPHP78330 225 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 SNAPC1Q16533 368 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 FBXO43Q4G163 708 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ATG9BQ674R7 924 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ATCAYQ86WG3 371 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 MYLPFQ96A32 169 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 WACQ9BTA9 647 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 ASAH2Q9NR71 780 aa14.52□□□□□ -0.08
MALSU1-202ENST00000466681 IRAK2O43187 625 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SOX14O95416 240 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 OTCP00480 354 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ARHGEF7Q14155 803 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 DSC3Q14574 896 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 POF1BQ8WVV4 589 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SPON2Q9BUD6 331 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SERHLQ9NQF3 203 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 DIABLOQ9NR28 239 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SCML1Q9UN30 329 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 RFXAPO00287 272 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 PEX11BO96011 259 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ETV6P41212 452 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MAGEA2P43356 314 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ABHD18Q0P651 414 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 VMACQ2NL98 169 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 KRT73Q86Y46 540 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 CD200R1Q8TD46 325 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 CLMPQ9H6B4 373 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 NUP50Q9UKX7 468 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 A0A1B0GVC2 190 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 A6NIN4 97 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 FFAR2O15552 330 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SERPINI2O75830 405 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TBX18O95935 607 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MC4RP32245 332 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 P2RY14Q15391 338 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 LGI4Q8N135 537 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 STK40Q8N2I9 435 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 GPR152Q8TDT2 470 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 USP34Q70CQ2 3546 aa14.51□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SRCP12931 536 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 PNPLA4P41247 253 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MAP2K3P46734 347 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 SUOXP51687 545 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 MGAT3Q09327 533 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 IL18Q14116 193 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 LBX2Q6XYB7 198 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 RDH10Q8IZV5 341 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 Q8N402 240 aa14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
MALSU1-202ENST00000466681 UPRTQ96BW1 309 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms