RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 F10P00742 488 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ICAM2P13598 275 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 AP2B1P63010 937 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 MGAT5Q09328 741 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PCOLCEQ15113 449 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 C4orf17Q53FE4 359 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CAPN12Q6ZSI9 719 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 MFSD9Q8NBP5 474 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SNX24Q9Y343 169 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 MAST4O15021 2626 aa18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RDH16O75452 317 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ITGAMP11215 1152 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CSHL1Q14406 222 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM205Q6UW68 189 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 OR56A3Q8NH54 315 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FBXL8Q96CD0 374 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TM4SF19Q96DZ7 209 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CYTH2Q99418 400 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 DYRK1BQ9Y463 629 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PSAT1Q9Y617 370 aa18.5■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 OR2W5A6NFC9 320 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF860A6NHJ4 632 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 DDAH2O95865 285 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RNF224P0DH78 156 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SHISA5Q8N114 240 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PSMF1Q92530 271 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 C5orf34Q96MH7 638 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 EGFL8Q99944 293 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RNF14Q9UBS8 474 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1W2PQ72 361 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 A8MUI8 341 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NDC80O14777 642 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CASQ1P31415 396 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SOX11P35716 441 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 EFNA3P52797 238 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF33BQ06732 778 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 RGS1Q08116 209 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF460Q14592 562 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 HERC3Q15034 1050 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 BTBD16Q32M84 506 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PDSS2Q86YH6 399 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 AMER2Q8N7J2 671 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 BBOF1Q8ND07 529 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 FAR1Q8WVX9 515 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NEIL2Q969S2 332 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 PEX11GQ96HA9 241 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 VPS39Q96JC1 886 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 OR4K3Q96R72 315 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TEKT2Q9UIF3 430 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.49■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa18.48■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.48■□□□□ 0.55
NPAS1-201ENST00000439365 CDC7O00311 574 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms