RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASPGQ86U10 573 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLD3Q8IV08 490 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LAX1Q8IWV1 398 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 THEM5Q8N1Q8 247 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR52N5Q8NH56 324 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMED6Q8WW62 240 aa4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIGBQ92521 554 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCRN2Q96FV2 425 aa4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DPH5Q9H2P9 285 aa4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TLE6Q9H808 572 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EBF2Q9HAK2 575 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPASTQ9UBP0 616 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STUB1Q9UNE7 303 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.56□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6A2O95222 327 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSTA2P09210 222 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCZ1BP86790 482 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAF3Q13114 568 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSD17B8Q92506 261 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPSTI1Q96J88 318 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SAMD8Q96LT4 415 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUCD1Q96NT3 240 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BTBD9Q96Q07 612 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB17Q9H0T7 212 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.54□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SOCS5O75159 536 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRT33AO76009 404 aa4.54□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINF2P08697 491 aa4.54□□□□□ -1.68
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UGT1A6P19224 532 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DGKAP23743 735 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ITGA3P26006 1051 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALDH4A1P30038 563 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLDN17P56750 224 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ10P78508 379 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYL7Q01449 175 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCGB2A2Q13296 93 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FGD3Q5JSP0 725 aa4.54□□□□□ -1.68
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