RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXCR2P25025 360 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COL8A1P27658 744 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FNTAP49354 379 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TDGF1P3P51864 188 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBPL1P62380 186 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARG2P78540 354 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCOLCEQ15113 449 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INAQ16352 499 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYT16Q17RD7 645 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADCK2Q7Z695 626 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BCORP1Q8N888 145 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HAS2Q92819 552 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAAR6Q96RI8 345 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF32Q9H0A6 362 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OLAHQ9NV23 265 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CREBBPQ92793 2442 aa8.91□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DYTNA2CJ06 578 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRTM2O43300 516 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STSP08842 583 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITGAMP11215 1152 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ICAM2P13598 275 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PGAM1P18669 254 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AVPR1BP47901 424 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AP2B1P63010 937 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSNK1G2P78368 415 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SP140Q13342 867 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PTK6Q13882 451 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRYMQ14894 314 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFA9Q16795 377 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCGF5Q86SE9 256 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SHISA5Q8N114 240 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AMER2Q8N7J2 671 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC138Q96M89 665 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDNQ99608 321 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SGPP1Q9BX95 441 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDE10AQ9Y233 779 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.9□□□□□ -0.98
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC16A5O15375 505 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 JRKO75564 520 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC4O95801 387 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TSPAN12O95859 305 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WDPCPO95876 746 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STATHP02808 62 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C8GP07360 202 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCND1P24385 295 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GABRB3P28472 473 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BCL6P41182 706 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RGS4P49798 205 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDKN2DP55273 166 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PER3P56645 1201 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PHKG1Q16816 387 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBCELQ5QJ74 424 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.89□□□□□ -0.99
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms