RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 S100A3P33764 101 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CPOXP36551 454 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 GRIA3P42263 894 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 UFM1P61960 85 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SQSTM1Q13501 440 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZIC1Q15915 447 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SPESP1Q6UW49 350 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PAQR7Q86WK9 346 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DSELQ8IZU8 1212 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 LIX1Q8N485 282 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 APIPQ96GX9 242 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MS4A8Q9BY19 250 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NLNQ9BYT8 704 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ABCG4Q9H172 646 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CLMPQ9H6B4 373 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YY10 115 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GTQ1 180 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 OR2A25A4D2G3 310 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MRASO14807 208 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NOBOXO60393 691 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TBX19O60806 448 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJA2O60884 412 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CIB2O75838 187 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TGFB1P01137 390 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SP9P0CG40 484 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DRD2P14416 443 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 UGT2B7P16662 529 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TRPC1P48995 793 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 GPLD1P80108 840 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RGS1Q08116 209 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RIPK1Q13546 671 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TLR1Q15399 786 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ADCK2Q7Z695 626 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 GPR180Q86V85 440 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ARL10Q8N8L6 244 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NT5CQ8TCD5 201 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PIGKQ92643 395 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RSC1A1Q92681 617 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 COQ8BQ96D53 544 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TCTN2Q96GX1 697 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ITCHQ96J02 903 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MARK4Q96L34 752 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 APOLD1Q96LR9 279 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM74Q96NL1 305 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 THTPAQ9BU02 230 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms