RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMA1P25391 3075 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRR3A8MPY1 467 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTPS1P17812 591 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFBP5P24593 272 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSKP43235 329 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMAT1Q5H9K5 638 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 POLE4Q9NR33 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN11A1L157 253 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX19O60806 448 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF10O60809 474 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GUCY1B2O75343 617 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GALTP07902 379 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOX5P09917 674 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD72P21854 359 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA1BP68363 451 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD51Q06609 339 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC23BQ15437 767 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GNASQ5JWF2 1037 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA1AQ71U36 451 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GAREM2Q75VX8 874 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATC1Q76KD6 591 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB15Q8WXK1 588 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ICKQ9UPZ9 632 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A10A0PJK1 596 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UGDHO60701 494 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN7O95471 211 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TFPIP10646 304 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 JUPP14923 745 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HNF1BP35680 557 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD23AP54725 363 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN5P54829 565 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1S1P61966 158 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COX20Q5RI15 118 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DESI1Q6ICB0 168 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A6Q92536 515 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52E6Q96RD3 313 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR83Q9NYM4 423 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF181Q9P0P0 153 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VCANP13611 3396 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R129 80 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK2P16519 638 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ALAS2P22557 587 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD6P3P58550 94 aa3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 FUT5Q11128 374 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HYAL2Q12891 473 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RGNQ15493 299 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM15Q9C019 465 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NL46 340 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGES3LE9PB15 166 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRTM2O43300 516 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLITRK5O94991 958 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD36P16671 472 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NFKBIAP25963 317 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPA1P29218 277 aa3.48□□□□□ -1.85
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