RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PGBD3Q8N328 593 aa18.03■□□□□ 0.48
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SH3BP1-202ENST00000417536 RNF6Q9Y252 685 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 E7EQ34 232 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GFYI3L273 518 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP9O43315 295 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM1AO60341 852 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 WEE1P30291 646 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TMED10P49755 219 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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