RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 KLF15Q9UIH9 416 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IGF2RP11717 2491 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF14O43557 240 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FKBP6O75344 327 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 JUNDP17535 347 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SDC1P18827 310 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CAPN3P20807 821 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ME2P23368 584 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IL12AP29459 219 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DPP6P42658 865 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NXPH1P58417 271 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ACTR3P61158 418 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CSNK1G2P78368 415 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PWP1Q13610 501 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TEAD4Q15561 434 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL35Q6PF15 583 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR2L3Q8NG85 312 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC58Q96CX6 371 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 APOLD1Q96LR9 279 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CDRT15Q96T59 188 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 HBEGFQ99075 208 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MCM8Q9UJA3 840 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RAB23Q9ULC3 237 aa9.4□□□□□ -0.9
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POLR1A-202ENST00000409024 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.4□□□□□ -0.9
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POLR1A-202ENST00000409024 MAST4O15021 2626 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 LRP4O75096 1905 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf74A8MZ97 194 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 TBX19O60806 448 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 KCNH1O95259 989 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 STAMBPO95630 424 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6V1G2O95670 118 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 PGRP06401 933 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 S100A3P33764 101 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 CNR2P34972 360 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 FASLGP48023 281 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 TRPC1P48995 793 aa9.39□□□□□ -0.91
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POLR1A-202ENST00000409024 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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POLR1A-202ENST00000409024 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 SNCBQ16143 134 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 MANEAQ5SRI9 462 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.39□□□□□ -0.91
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POLR1A-202ENST00000409024 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF425Q6IV72 752 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 RETREG3Q86VR2 466 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 SYT12Q8IV01 421 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 FRMD1Q8N878 549 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-202ENST00000409024 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.39□□□□□ -0.91
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