RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SCN3AQ9NY46 2000 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 OR1F1O43749 312 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 RDH16O75452 317 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CELA2AP08217 269 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 PCOLCEQ15113 449 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 OR1N1Q8NGS0 311 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 OR56A3Q8NH54 315 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 GRHL3Q8TE85 626 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 RNF14Q9UBS8 474 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SNX24Q9Y343 169 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 DYRK1BQ9Y463 629 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 PSAT1Q9Y617 370 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 A0A1W2PQ72 361 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF860A6NHJ4 632 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ICAM2P13598 275 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CSHL1Q14406 222 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM205Q6UW68 189 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 FRA10AC1Q70Z53 315 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 BBOF1Q8ND07 529 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 EGFL8Q99944 293 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 RBCK1Q9BYM8 510 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 A1L4Q6 167 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 F10P00742 488 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SLC12A2P55011 1212 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 CALCOCO2Q13137 446 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF460Q14592 562 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 LANCL3Q6ZV70 420 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 TM4SF19Q96DZ7 209 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 VPS39Q96JC1 886 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-202ENST00000378546 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TRBC2A0A5B9 178 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 DDAH2O95865 285 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CYC1P08574 325 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ITGAMP11215 1152 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SOX11P35716 441 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SKP1P63208 163 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 RGS1Q08116 209 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 HERC3Q15034 1050 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CATSPEREQ5SY80 951 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SBSNQ6UWP8 590 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PSMF1Q92530 271 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PEX11GQ96HA9 241 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 C5orf34Q96MH7 638 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OR4K3Q96R72 315 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 DPH5Q9H2P9 285 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TEKT2Q9UIF3 430 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 IKZF3Q9UKT9 509 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 MAST4O15021 2626 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TRAV17A0A0B4J275 112 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 RNF224P0DH78 156 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 AGTR2P50052 363 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 EFNA3P52797 238 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF33BQ06732 778 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 BTBD16Q32M84 506 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PDSS2Q86YH6 399 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 NEIL2Q969S2 332 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CYTH2Q99418 400 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SLC22A7Q9Y694 548 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ICE1Q9Y2F5 2266 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms