RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CACHD1Q5VU97 1274 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 MFSD9Q8NBP5 474 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PRSS33Q8NF86 280 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TEX37Q96LM6 180 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TSSK3Q96PN8 268 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SERPINI1Q99574 410 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 A0A0G2JN53 185 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LNP1A1A4G5 178 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 NDUFS4O43181 175 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 B4GAT1O43505 415 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TNFSF14O43557 240 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SH3BP5O60239 455 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SDC1P18827 310 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 NCALDP61601 193 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 DEFB110Q30KQ9 67 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G2CQ5R387 149 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PERM1Q5SV97 790 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 NOXRED1Q6NXP6 359 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 USP53Q70EK8 1073 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LRFN3Q9BTN0 628 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 BRINP2Q9C0B6 783 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB1P30740 379 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CSF2RBP32927 897 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RAP1GDS1P52306 607 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RAE1P78406 368 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SMU1Q2TAY7 513 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FBXO27Q8NI29 283 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 AICDAQ9GZX7 198 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 ACTL8Q9H568 366 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.99■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SLC22A2O15244 555 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 DUX1O43812 170 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 UNC5CO95185 931 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 LRATO95237 230 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 MAPK1P28482 360 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TCF15Q12870 199 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SPIN4Q56A73 249 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RINLQ6ZS11 566 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SPRED1Q7Z699 444 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TTLQ8NG68 377 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 KLHL31Q9H511 634 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FAM60AQ9NP50 221 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 ASIC5Q9NY37 505 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 C4orf51C9J302 202 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PLPP1O14494 284 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 P2RX6O15547 441 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PCDH7O60245 1069 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGA12O60330 932 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CLEC3AO75596 197 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 SLC22A3O75751 556 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 RASSF9O75901 435 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 MYO1DO94832 1006 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 FKBP9O95302 570 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 CALB2P22676 271 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 IL12AP29459 219 aa16.98■□□□□ 0.31
LTV1-201ENST00000367576 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.313e-8■■□□□ 13.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms