RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 I6L893 689 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SHOXO15266 292 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PRAMEF10O60809 474 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 OPN1SWP03999 348 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ATF6P18850 670 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 KDELC1Q6UW63 502 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CCDC190Q86UF4 302 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 OR52E6Q96RD3 313 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FAM234BA2RU67 622 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 DPYSL4O14531 572 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZNF623O75123 536 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 DNAJB5O75953 348 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 C9P02748 559 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 BMP1P13497 986 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 HLA-DPA1P20036 260 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ATP4BP51164 291 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RAB8AP61006 207 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RAB14P61106 215 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZXDBP98169 803 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZNF79Q15937 498 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TCTN1Q2MV58 587 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 BEST4Q8NFU0 473 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ST8SIA4Q92187 359 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FANCFQ9NPI8 374 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SLC35F4A4IF30 521 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ISM1B1AKI9 464 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 GPX5O75715 221 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ADRA1BP35368 520 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 NUDT1P36639 197 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ERVK-21P61565 698 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 HYAL2Q12891 473 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 NPRL3Q12980 569 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LCP2Q13094 533 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RFX4Q33E94 735 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CPZQ66K79 652 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 EFHBQ8N7U6 833 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TSSK3Q96PN8 268 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 DPY30Q9C005 99 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 REEP1Q9H902 201 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CFL2Q9Y281 166 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 HMBSP08397 361 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 DAOAP59103 153 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 KCTD11Q693B1 232 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 GJB3O75712 270 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MATN4O95460 622 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 AKT1P31749 480 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 EPHA5P54756 1037 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 WNT3AP56704 352 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MAB21L1Q13394 359 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 IL18Q14116 193 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 DSG2Q14126 1118 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PJA1Q8NG27 643 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 OR2T29Q8NH02 315 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TRMOQ9BU70 441 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MUC13Q9H3R2 512 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MPP6Q9NZW5 540 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 GSAPA4D1B5 854 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms