RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 SUPT3HO75486 399 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GPC4O75487 556 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RASGRP1O95267 797 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 MT-CO1P00395 513 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PRR35P0CG20 571 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SRCP12931 536 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ITGALP20701 1170 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SPAM1P38567 509 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CLCN7P51798 805 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PKNOX1P55347 436 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 OR1D5P58170 312 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 STX1BP61266 288 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SH3BP2P78314 561 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CLCQ05315 142 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GSTA3Q16772 222 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PFKFB4Q16877 469 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 MUM1Q2TAK8 710 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 COQ5Q5HYK3 327 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 OGFOD2Q6N063 350 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RPTNQ6XPR3 784 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GPSM1Q86YR5 675 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 TMIEQ8NEW7 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 NRG4Q8WWG1 115 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 NINJ1Q92982 152 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RCN3Q96D15 328 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 EID2BQ96D98 161 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 LINGO1Q96FE5 620 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF382Q96SR6 550 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ING2Q9H160 280 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 WDR41Q9HAD4 459 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PCTPQ9UKL6 214 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 C19orf84I3L1E1 186 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 K7ERQ8 282 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 BTN3A1O00481 513 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 E2F3O00716 465 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 AP1G1O43747 822 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 BNIP3LO60238 219 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PDE5AO76074 875 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ESRRBO95718 433 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 PRNPP04156 253 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CBSLP0DN79 551 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 UROSP10746 265 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 EDN3P14138 238 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 LBPP18428 481 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GPX3P22352 226 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ME2P23368 584 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ACRV1P26436 265 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CD1CP29017 333 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 ALDH4A1P30038 563 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CBSP35520 551 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RGS4P49798 205 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 NFATC2Q13469 925 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SQSTM1Q13501 440 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 LRP8Q14114 963 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 UGT8Q16880 541 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 SPATS1Q496A3 300 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 XKR7Q5GH72 579 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 REP15Q6BDI9 236 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 IRGCQ6NXR0 463 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 MTFR2Q6P444 385 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 TTC23LQ6PF05 361 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 GK5Q6ZS86 529 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 Q6ZVU0 165 aa7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SNORD46-201ENST00000364043 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms