RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 AOC1P19801 751 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN17P56750 224 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM106AQ4KMX7 169 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUSD4Q5VX71 490 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RX5Q93086 422 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF6BQ99941 703 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB1Q9H4B7 451 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNB4Q9HAV0 340 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RARRES3Q9UL19 164 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARID2Q68CP9 1835 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPW3 197 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FIBPO43427 364 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECE2O60344 883 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAP91O60641 907 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX10O75333 385 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PENKP01210 267 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD59P13987 128 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 BDNFP23560 247 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC25CP30307 473 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS7P49802 495 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCN4P51793 760 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDST2P52849 883 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUCB1Q02818 461 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SULT2A1Q06520 285 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD300CQ08708 224 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP5Q16690 384 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUT10Q6P4F1 479 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF841Q6ZN19 808 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGWQ7Z7B1 504 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM219AQ8IW50 185 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A11Q8N1S5 342 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF597Q96LX8 424 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTSE1Q9NYZ3 720 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLKQ9UBT6 870 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL27Q9Y4X3 112 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGRNO00468 2067 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHISA7A6NL88 538 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MVM7 634 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC188H7C350 402 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITIH1P19827 911 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4BPBP20851 252 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL4RP24394 825 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMA3P25788 255 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3R1P27986 724 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR183P32249 361 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETV5P41161 510 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMK2P53671 638 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD23AP54725 363 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPECC1Q5M775 1068 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOXD1Q6UVY6 613 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms