RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 VSTM5A8MXK1 200 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HLA-EP13747 358 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OPRL1P41146 370 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PITPNBP48739 271 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD18Q0P651 414 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC120Q96HB5 630 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CD180Q99467 661 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MYPNQ86TC9 1320 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TISP43B9A030 160 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 UBBP0CG47 229 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKXP51817 358 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH12P55289 794 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MTPNP58546 118 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 UBA52P62987 128 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF529Q6P280 563 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF366Q8N895 744 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SIMC1Q8NDZ2 872 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTN3Q9P232 1028 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NAT1P18440 290 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HLCSP50747 726 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CLCN7P51798 805 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB8AP61006 207 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MBLAC2Q68D91 279 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ARSKQ6UWY0 536 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SUSD6Q92537 303 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL15Q96M94 604 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HCRTR2O43614 444 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HRGP04196 525 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HCAR3P49019 387 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 20.9
SH3BP2-201ENST00000356331 FGL2Q14314 439 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ8Q15842 424 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTM4Q03013 218 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MON1AQ86VX9 555 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL5CA6NH57 179 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AIPO00170 330 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 B4GALT4O60513 344 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ELFN1P0C7U0 828 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DNASE1P24855 282 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CMPK1P30085 196 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF33BQ06732 778 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GALEQ14376 348 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM198Q66K66 360 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD13Q7L211 337 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LGALS12Q96DT0 336 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 P2RY11Q96G91 374 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EQTNQ9NQ60 294 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVW-1Q9UQF0 538 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLX4Q8IY92 1834 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CIB4A0PJX0 185 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTN5O94779 1100 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LATS1O95835 1130 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH1Q08174 1060 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PLD4Q96BZ4 506 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SCRN2Q96FV2 425 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SDCBP2Q9H190 292 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP98P52948 1817 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 P2RX6O15547 441 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EVI2BP34910 448 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms