RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 VPS4AQ9UN37 437 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF33A8MVX0 844 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 MTX2O75431 263 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 UGT2B10P36537 528 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 GAB1Q13480 694 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC73Q5JTD7 316 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 CADM3Q8N126 398 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM169Q96HH4 297 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 DACH2Q96NX9 599 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 SGK2Q9HBY8 427 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A13Q9UJS0 675 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-201ENST00000355530 GABRR3A8MPY1 467 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ZBBXA8MT70 800 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 AIREO43918 545 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 RFPL2O75678 378 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 URODP06132 367 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF30P17039 623 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 GABRR2P28476 465 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 DCDC1P59894 354 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 RAE1P78406 368 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 PCDH1Q08174 1060 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 DNASE1L3Q13609 305 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SPIN4Q56A73 249 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 RAET1EQ8TD07 263 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CXorf40BQ96DE9 158 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 KCNC2Q96PR1 638 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 MMP27Q9H306 513 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM17Q9Y577 477 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 AQP9O43315 295 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SGTAO43765 313 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 HOXD10P28358 340 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 AQP1P29972 269 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 LIPAP38571 399 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 MAL2Q969L2 176 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 COQ8BQ96D53 544 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 MED8Q96G25 268 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SCLYQ96I15 445 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 FKBP14Q9NWM8 211 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 MGAT4DA6NG13 374 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF11BO00300 401 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 QSOX1O00391 747 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 IDSP22304 550 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 HLA-FP30511 346 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CTSKP43235 329 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SELENOWP63302 87 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TEKQ02763 1124 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SF1Q15637 639 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 HKDC1Q2TB90 917 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF404Q494X3 552 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SYTL3Q4VX76 610 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CATSPEREQ5SY80 951 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TUBA3EQ6PEY2 450 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 LACC1Q8IV20 430 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CMTM8Q8IZV2 173 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 OR4A15Q8NGL6 344 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 FAM83DQ9H4H8 585 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFAF4Q9P032 175 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 A3GALT2U3KPV4 340 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ISPDA4D126 451 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SAGE2PA6NJ88 616 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 GRM6O15303 877 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 KDM1AO60341 852 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 ETHE1O95571 254 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CXCL10P02778 98 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 INHAP05111 366 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TGFBR1P36897 503 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 CD300CQ08708 224 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 NAE1Q13564 534 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 SYT16Q17RD7 645 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 TIGD6Q17RP2 521 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 USP43Q70EL4 1123 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-201ENST00000355530 GAREM2Q75VX8 874 aa17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms