RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 NUDT1P36639 197 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 HPCAL1P37235 193 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OR4D2P58180 307 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CSNK1G2P78368 415 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PROSER1Q86XN7 944 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 WDR48Q8TAF3 677 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GBP5Q96PP8 586 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 IKZF5Q9H5V7 419 aa23.32■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 A6NCN8 305 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GABRR3A8MPY1 467 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ACADSP16219 412 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ATP6V1C1P21283 382 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CDKN2CP42773 168 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TRPC1P48995 793 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 STARD6P59095 220 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 DUOXA1Q1HG43 343 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CANT1Q8WVQ1 401 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 WNT16Q9UBV4 365 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MCM8Q9UJA3 840 aa23.31■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 FEZF1A0PJY2 475 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PEX1O43933 1283 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SEMA3DO95025 777 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 LAMP1P11279 417 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 NCK1P16333 377 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC36Q1X8D7 754 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CPTPQ5TA50 214 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 NRROSQ86YC3 692 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 DUSP26Q9BV47 211 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MS4A8Q9BY19 250 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 AHSPQ9NZD4 102 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 BTBD3Q9Y2F9 522 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 DHRS12A0PJE2 317 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 FAM170BA6NMN3 283 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 F3P13726 295 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 HRH2P25021 359 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SHMT2P34897 504 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ABATP80404 500 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 FRMD1Q8N878 549 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OR10A6Q8NH74 314 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MIEF2Q96C03 454 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 COQ8BQ96D53 544 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SHDQ96IW2 340 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GUCD1Q96NT3 240 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ATP6V1HQ9UI12 483 aa23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 KLHL18O94889 574 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TNFP01375 233 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GBAP04062 536 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GSNP06396 782 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 KLK1P06870 262 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CYP4F2P78329 520 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 ADCK2Q7Z695 626 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OR2T12Q8NG77 320 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 RLN3Q8WXF3 142 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC115Q96NT0 180 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 FOXQ1Q9C009 403 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 MYNNQ9NPC7 610 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GPR27Q9NS67 375 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 FBXL21Q9UKT6 434 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 INVSQ9Y283 1065 aa23.29■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 A0A1W2PPC4 97 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 OR1F1O43749 312 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 SOX11P35716 441 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 GLYATQ6IB77 296 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.28■■□□□ 1.32
SERF1A-202ENST00000354833 C16orf78Q8WTQ4 265 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms