RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SEPHS2Q99611 448 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 AIF1LQ9BQI0 150 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ICKQ9UPZ9 632 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 KLK1P06870 262 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 UMPSP11172 480 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 HPCAL1P37235 193 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 REEP5Q00765 189 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 FOLH1Q04609 750 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SLC14A1Q13336 389 aa17.16■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 OR2L8Q8NGY9 312 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CCL4L1Q8NHW4 92 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.341e-323■■□□□ 12.2
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ACTB-201ENST00000331789 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CCDC115Q96NT0 180 aa17.16■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 RHBGQ9H310 441 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 MVB12BQ9H7P6 319 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D29Q9UFV1 150 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ELOVL7A1L3X0 281 aa17.15■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 SEMA4FO95754 770 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 BMP2P12643 396 aa17.15■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 MC1RQ01726 317 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PRKCQQ04759 706 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 KLC1Q07866 573 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF385BQ569K4 471 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 MICU2Q8IYU8 434 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ANKFN1Q8N957 763 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 OR4K1Q8NGD4 311 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 STARD8Q92502 1023 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 COQ8BQ96D53 544 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SLC29A1Q99808 456 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CIB1Q99828 191 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.15■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 PLD3Q8IV08 490 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SNX19Q92543 992 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 BTBD9Q96Q07 612 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 F2RL3Q96RI0 385 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 FAM220BPB1ANY3 271 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 CXCR6O00574 342 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 ENGP17813 658 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 FASP25445 335 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 HTR1BP28222 390 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 AKT2P31751 481 aa17.14■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 CSNK1G2P78368 415 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 C2orf80Q0P641 193 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 TDGQ13569 410 aa17.14■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 NRF1Q16656 503 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 CAMKMTQ7Z624 323 aa17.14■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 TNIP2Q8NFZ5 429 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 GATA6Q92908 595 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 REEP4Q9H6H4 257 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 GORASP2Q9H8Y8 452 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa17.13■□□□□ 0.33
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