RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 CSF3RQ99062 836 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SPASTQ9UBP0 616 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PSME2Q9UL46 239 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 G3V2T6 193 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FPGTO14772 594 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ACOX3O15254 700 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 XPNPEP2O43895 674 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CA3P07451 260 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 LAMP1P11279 417 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CAPGP40121 348 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 KIR3DL1P43629 444 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PLA2G16P53816 162 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PFN3P60673 137 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NFE2L1Q14494 772 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ERAP2Q6P179 960 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 LIPIQ6XZB0 460 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 GLYATL1Q969I3 302 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PCDH8O95206 1070 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 EPHX1P07099 455 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 AGXTP21549 392 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 HTR1EP28566 365 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 IFNA8P32881 189 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PTGER1P34995 402 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MC1RQ01726 317 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CEP78Q5JTW2 689 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 BROXQ5VW32 411 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NDNFQ8TB73 568 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NEIL2Q969S2 332 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PKP4Q99569 1192 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NTMT1Q9BV86 223 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TRANK1O15050 2925 aa9.75□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MGAT4DA6NG13 374 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 WNT9AO14904 365 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SNPHO15079 494 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ATG13O75143 517 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CREG1O75629 220 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 IL6P05231 212 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 C8GP07360 202 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ENGP17813 658 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 MYF6P23409 242 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 DCKP27707 260 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SHMT2P34897 504 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FOXM1Q08050 763 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ATP6AP1Q15904 470 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NDUFA5Q16718 116 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CDONQ4KMG0 1287 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ADCK2Q7Z695 626 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PLD3Q8IV08 490 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PMEPA1Q969W9 287 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FOPNLQ96NB1 174 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 OR4K3Q96R72 315 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 RAD9AQ99638 391 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 DYRK4Q9NR20 520 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ASF1AQ9Y294 204 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 EVPLLA8MZ36 301 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 FTH1P02794 183 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CATP04040 527 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PCCBP05166 539 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00271P0C7V0 271 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 GGT1P19440 569 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 NRIP1P48552 1158 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ARSFP54793 590 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 DAB2P98082 770 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 IFITM3Q01628 133 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 AQP6Q13520 282 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 CAMK1Q14012 370 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF846Q147U1 533 aa9.74□□□□□ -0.85
FOXN4-201ENST00000299162 PON2Q15165 354 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms