RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 FGD3Q5JSP0 725 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 TMEM240Q5SV17 173 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 XKR5Q6UX68 686 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 OR9A1PQ8NGU1 263 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 CNIH3Q8TBE1 160 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 COQ8BQ96D53 544 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 CHST8Q9H2A9 424 aa18.52■□□□□ 0.56
USP21-201ENST00000289865 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 FPR1P21462 350 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 EMP3P54852 163 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 FPGSQ05932 587 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 IL18R1Q13478 541 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 VEZF1Q14119 521 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF385BQ569K4 471 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZFP90Q8TF47 636 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 MAL2Q969L2 176 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 VPS4AQ9UN37 437 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PIPSLA2A3N6 862 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 LINC01553A4QN01 128 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ADRB3P13945 408 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 RYKP34925 604 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF763Q0D2J5 394 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 RGNQ15493 299 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 COMMD6Q7Z4G1 85 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CPA6Q8N4T0 437 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TMIEQ8NEW7 156 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SGPP1Q9BX95 441 aa18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PTGES3LE9PB15 166 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 UGT2B11O75310 529 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TGFB1P01137 390 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 AQP1P29972 269 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CDK5R2Q13319 367 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TUBA3CQ13748 450 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 NFE2L1Q14494 772 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF765Q7L2R6 523 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 OR4K1Q8NGD4 311 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 THAP11Q96EK4 314 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ETAA1Q9NY74 926 aa18.5■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TRIM64BA6NI03 449 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CD247P20963 164 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TMBIM6P55061 237 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TAP2Q03519 686 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 UBE3AQ05086 875 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ARMCX6Q7L4S7 300 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 NAGSQ8N159 534 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 WDR48Q8TAF3 677 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 WDR34Q96EX3 536 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 MAGED4Q96JG8 741 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SPNS1Q9H2V7 528 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 OR51B5Q9H339 312 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 REEP4Q9H6H4 257 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ATP6V1HQ9UI12 483 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 SNX5Q9Y5X3 404 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 PAPLNO95428 1278 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ENTPD1P49961 510 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CRYBA2P53672 197 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 CASP9P55211 416 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 ITGA1P56199 1179 aa18.49■□□□□ 0.55
USP21-201ENST00000289865 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms