RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GJB7Q6PEY0 223 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 REPS1Q96D71 796 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CXorf58Q96LI9 332 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SPATA33Q96N06 139 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 S100A13Q99584 98 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 C1orf50Q9BV19 199 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RAB33BQ9H082 229 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.841e-6■□□□□ 9.7
LATS1-201ENST00000253339 CD207Q9UJ71 328 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PSME2Q9UL46 239 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMCO1Q9UM00 188 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KBTBD13C9JR72 458 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPS6KA4O75676 772 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LCA5LO95447 670 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NDUFB7P17568 137 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ACADLP28330 430 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NMBRP28336 390 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EPHB2P29323 1055 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GTF2H1P32780 548 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ETV4P43268 484 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ARHGDIBP52566 201 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PRRX1P54821 245 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AIF1P55008 147 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ARPC4P59998 168 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ACTR3P61158 418 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PKN1Q16512 942 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCDC153Q494R4 210 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC36A3Q495N2 470 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PRR5LQ6MZQ0 368 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TIGD4Q8IY51 512 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RNF149Q8NC42 400 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RIT1Q92963 219 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCDC120Q96HB5 630 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AGAP3Q96P47 875 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KIFC1Q9BW19 673 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ANKARQ7Z5J8 1434 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EXTL3O43909 919 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MFN2O95140 757 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PLEKHA8P1O95397 391 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 C1RP00736 705 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TFP02787 698 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CLUP10909 449 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCDC130P13994 396 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GNSP15586 552 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AGAP20933 346 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TGM2P21980 687 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MYL6P60660 151 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TNFRSF17Q02223 184 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms