RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SMU1Q2TAY7 513 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SPNS2Q8IVW8 549 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE10AQ9Y233 779 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF7Q14155 803 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf141Q5SZD1 244 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 STK32CQ86UX6 486 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 S100ZQ8WXG8 99 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAMP4Q969E2 229 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 LYSMD1Q96S90 227 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3GL1Q99961 368 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 HMG20AQ9NP66 347 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM118AQ9NWS6 357 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENONQ9NZV5 590 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX5Q9Y5X3 404 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR4O00206 839 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PCCBP05166 539 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 THEGLP0DJG4 465 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ITIH1P19827 911 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SHMT2P34897 504 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G16P53816 162 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT18Q6P9A2 607 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZSR6 202 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB12Q8WXK4 309 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 EDEM2Q9BV94 578 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL10Q9BXB5 764 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM8Q9BZR9 551 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTL3 188 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 JAK1P23458 1154 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 IL12AP29459 219 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX4Q33E94 735 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM219BQ5XKK7 198 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T11Q8NH01 316 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 MUL1Q969V5 352 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 MED16Q9Y2X0 877 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1A2Q9Y585 309 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT1P36639 197 aa25.39■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 PYCR3Q53H96 274 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 GPSM1Q86YR5 675 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE9Q8IYJ1 553 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3C3Q8NEB9 887 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR3AQ9H497 397 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAMF8Q9P0V8 285 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF225Q9UK10 706 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC7O00311 574 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH1O95259 989 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MSH3P20585 1137 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSKP43235 329 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IL2P60568 153 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRCAPQ14761 206 aa25.39■■□□□ 1.65
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF542PQ5EBM4 170 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A7Q6PXP3 512 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 DTD2Q96FN9 168 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC7BQ96G42 594 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC138Q96M89 665 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD3AQ9NVI7 634 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT4Q9NZJ9 180 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP5Q9UJA9 477 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F3O00716 465 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FPGTO14772 594 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SCELO95171 688 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TTPAP49638 278 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPH1P58417 271 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 AGERQ15109 404 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TEAD4Q15561 434 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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