RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim15G3UY57 292 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20441G3UYJ7 252 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpna4O35343 521 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf143O70230 638 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-Q8P14430 326 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc10a2P70172 348 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-Q6P79568 326 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf2raQ00941 388 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccbe1Q3MI99 408 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HjurpQ6PG16 667 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fastkd3Q8BSN9 661 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cers6Q8C172 384 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex5lQ8C437 567 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700020N01RikQ8CF20 87 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmcd1Q8VEE1 365 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab30Q923S9 203 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim33Q99PP7 1142 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt17Q9CWD3 296 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CZV2 255 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DguokQ9QX60 277 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem236A2ARJ3 344 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam71f2B2RXB0 297 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec14l5B2RXM5 696 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8237E9Q257 205 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k7clP58500 142 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk2P97438 426 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emx1Q04742 257 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrtc1bQ2PMX6 267 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr149Q3UVY1 732 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec12aQ504P2 267 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BadQ61337 204 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il10raQ61727 575 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam149b1Q6NSV7 578 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp324Q78F42 583 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl26Q8BGY4 606 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd49Q8VE42 238 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr806Q8VFI2 313 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr575Q8VH16 318 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhrs7Q9CXR1 338 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco6d1Q9D5W6 683 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nipa2Q9JJC8 359 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r119Q9JKT2 335 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem235B1AQL3 211 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlgap4B1AZP2 992 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp871G5E905 615 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angpt2O35608 496 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp1b2P14231 290 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbl1P39039 239 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt2P56380 147 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isl1P61372 349 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk18Q04899 451 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EndouQ3V188 412 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AbrQ5SSL4 859 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou4f2Q63934 411 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irf4Q64287 450 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr814Q7TRH4 310 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr171Q8BG55 319 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Susd6Q8BGE4 302 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpf18Q8BM39 342 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elmo1Q8BPU7 727 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr22Q8BZL4 432 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nuak2Q8BZN4 639 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LzicQ8K3C3 190 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GaleQ8R059 347 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm1Q8VC85 133 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1469Q8VFW5 309 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhga9Q91XX9 932 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrl4Q923X1 739 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Riok2Q9CQS5 547 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uba7Q9DBK7 977 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam13cQ9DBR2 601 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HgfacQ9R098 653 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4galt6Q9WVK5 382 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a4Q9Z306 553 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7714E9Q079 131 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs4O08899 205 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C4bpaP08607 469 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtpaP58389 323 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac2P70288 488 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SgcgP82348 291 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BcheQ03311 603 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim24Q0VG18 120 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jmjd8Q3TA59 316 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxk2Q3UCQ1 651 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eri2Q5BKS4 688 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IspdQ5RJG7 447 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znrf3Q5SSZ7 913 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.2 ms