RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC12A3P55017 1021 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 EVCP57679 992 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 NPRL3Q12980 569 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 STPG1Q5TH74 334 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 G2E3Q7L622 706 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 TAF4BQ92750 862 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LMLNQ96KR4 655 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 C4orf45Q96LM5 186 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 TSSK2Q96PF2 358 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 STX8Q9UNK0 236 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0B4J203 849 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT87PA6NCN2 255 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CPLX1O14810 134 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 EPHB6O15197 1021 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP9AO75110 1047 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GLRA3O75311 464 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC4A1P02730 911 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM200BP0CF97 657 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 DLATP10515 647 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 SERPINB6P35237 376 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF131P52739 623 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 STARD6P59095 220 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNJ10P78508 379 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 MYL7Q01449 175 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC38Q5VT99 294 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR141Q7Z602 305 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LRTM2Q8N967 370 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 OR4C3Q8NH37 302 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 PIK3R3Q92569 461 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 AP2M1Q96CW1 435 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 UHRF2Q96PU4 802 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 BTBD9Q96Q07 612 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ABCG4Q9H172 646 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 UBQLN3Q9H347 655 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 IL19Q9UHD0 177 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 APPL1Q9UKG1 709 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 STAM2O75886 525 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CDK2AP2O75956 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 IGLV2-11P01706 119 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP1B1P05026 303 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 VCLP18206 1134 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 IL10P22301 178 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 DNA2P51530 1060 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 LBX1P52954 281 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA1024LP59773 190 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CETN1Q12798 172 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RPS6KA1Q15418 735 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GTDC1Q4AE62 458 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 XKR6Q5GH73 641 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 SUSD6Q92537 303 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 GIMAP5Q96F15 307 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 IDI2Q9BXS1 227 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 C1orf21Q9H246 121 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCA2-241ENST00000635397 CUEDC2Q9H467 287 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms