RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CD200R1Q8TD46 325 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf66Q96MD2 445 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PANX3Q96QZ0 392 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX7Q9UNH6 387 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 E5RI56 91 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TFEBP19484 476 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PGGT1BP53609 377 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CGB2Q6NT52 195 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO1Q9UM00 188 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NL46 340 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DLX3O60479 287 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPSNAP2O75323 286 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN12O95859 305 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56A5P0C7T3 313 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MSL3P1P0C860 447 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CBSLP0DN79 551 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CBSP35520 551 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA20P61599 178 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1A4Q13733 1029 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DET1Q7L5Y6 550 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 HPS6Q86YV9 775 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SYTL1Q8IYJ3 562 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2L2Q8NH16 312 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR7Q8TB68 274 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 POLEQ07864 2286 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA5O15131 536 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CBX6O95503 412 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TPBGLP0DKB5 382 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GLRBP48167 497 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A6P48664 564 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MED25Q71SY5 747 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SLAMF7Q9NQ25 335 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SOHLH2Q9NX45 425 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS4P49798 205 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HK2P52789 917 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL7AQ4VC05 210 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4E2Q8NGC2 313 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 DRC3Q9H069 523 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR83Q9NYM4 423 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HAO1Q9UJM8 370 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCE1LA8MT33 242 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB14O43829 449 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NPHS1O60500 1241 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KERAO60938 352 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO13O94829 963 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ST6GAL1P15907 406 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPSNQ13702 412 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NCF4Q15080 339 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NR6A1Q15406 480 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CES4AQ5XG92 561 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KIRREL3Q8IZU9 778 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CNDP1Q96KN2 507 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ASF1BQ9NVP2 202 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GALPQ9UBC7 116 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BMH7 237 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 BTN3A3O00478 584 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN19Q8N6F1 224 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PTERQ96BW5 349 aa23.12■■□□□ 1.29
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