RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 GRK3P35626 688 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 STX5Q13190 355 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL3Q13618 768 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGR1Q14914 329 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIN4Q56A73 249 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PLD3Q8IV08 490 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51B5Q9H339 312 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC52A3Q9NQ40 469 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT5Q9NXA8 310 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SDK1Q7Z5N4 2213 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1EQ15878 2313 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP73A6NFT4 308 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 HAT1O14929 419 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF14O43557 240 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BGRLO75368 114 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP9O95302 570 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK2P16519 638 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 IL12AP29459 219 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 DPP6P42658 865 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ2P63252 427 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 MXRA7P84157 204 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSM2AQ08AH3 577 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A12Q1EHB4 618 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 DUOXA1Q1HG43 343 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSM2BQ68CK6 577 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PAQR7Q86WK9 346 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 OOSP2Q86WS3 158 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLQ8NG68 377 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPEARQ8WU66 669 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RCN3Q96D15 328 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A8Q9BY19 250 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PRM3Q9NNZ6 103 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GTQ1 180 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM234BA2RU67 622 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA5A6NI73 299 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FBP2O00757 339 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SDC1P18827 310 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL6P41182 706 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 RCAN2Q14206 197 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SPESP1Q6UW49 350 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB1Q9HAE3 211 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK4Q9Y5K2 254 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 C9JVG2 144 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 NR5A2O00482 541 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 AIM2O14862 343 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 GSC2O15499 205 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN3P20807 821 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TACR1P25103 407 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTM2P28161 218 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4F2P78329 520 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A3Q00325 362 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT18Q6P9A2 607 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RABEPKQ7Z6M1 372 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM73Q86UV7 250 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM9CQ8IZT9 166 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL4Q8N3J2 472 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D19Q8N5T2 526 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KYQ8NBH2 561 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP76Q8TAP6 659 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CREB3L4Q8TEY5 395 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RSC1A1Q92681 617 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKMY1Q9P2S6 941 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2A25A4D2G3 310 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC3AO75596 197 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO1DO94832 1006 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN7O94888 489 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 AHRP35869 848 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN8P56748 225 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK10P57789 538 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 REP15Q6BDI9 236 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDL1Q96EA4 605 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A3Q99624 504 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 NPAS2Q99743 824 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY30Q9C005 99 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN10Q9HC96 672 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.83■■□□□ 1.41
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