RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GPR25	O00155	361 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MT-ND5	P03915	603 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TYR	P14679	529 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MATN1	P21941	496 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CRISP1	P54107	249 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SRY	Q05066	204 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IRF5	Q13568	498 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	JUP	P14923	745 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2B6	P58173	313 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ASB12	Q8WXK4	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PKP4	Q99569	1192 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VILL	O15195	856 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PEX10	O60683	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MREG	Q8N565	214 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CD180	Q99467	661 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ACTL6B	O94805	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PCSK2	P16519	638 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB28	P51157	221 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ID2	Q02363	134 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DAOA	P59103	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SSX5	O60225	188 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAD51D	O75771	328 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IFNGR1	P15260	489 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SMS	P52788	366 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672		B8ZZF3	427 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SYP	P08247	313 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OTX2	P32243	289 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PFKL	P17858	780 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CDH11	P55287	796 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MALL	Q13021	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ENTPD6	O75354	484 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CD48	P09326	243 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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