RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.11□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.11□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H2ADP20671 130 aa11.09□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR10G6Q8NH81 332 aa11.09□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.09□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.09□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 MGARPQ8TDB4 240 aa11.09□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.09□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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