RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1S	P09871	688 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITGA2	P17301	1181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPOR	P19235	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MATN1	P21941	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PTPN6	P29350	595 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NBL1	P41271	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLA2G16	P53816	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEK	Q02763	1124 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RBBP4	Q09028	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAM15	Q13444	863 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NKG7	Q16617	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MEP1A	Q16819	746 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DUSP26	Q9BV47	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A0U1RQS6	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516		A8MVJ9	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516		M0R3G1	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SUV39H1	O43463	412 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RGS10	O43665	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	C9	P02748	559 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NTRK1	P04629	796 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	UGT2B4	P06133	528 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADH1A	P07327	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITGA1	P56199	1179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PHC1	P78364	1004 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	VMP1	Q96GC9	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	APIP	Q96GX9	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSMD11	O00231	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	AREL1	O15033	823 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEX28	O15482	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNK5	O95279	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL7R	P16871	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GK	P32189	559 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCGF2	P35227	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	BMPR1A	P36894	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PFN3	P60673	137 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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