RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ONECUT2	O95948	504 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	LIF	P15018	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GNAZ	P19086	355 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CASP2	P42575	452 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EMP3	P54852	163 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TRAF3	Q13114	568 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GRM7	Q14831	915 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6	5e-6	■■■■■ 29.2
USP22-211	ENST00000584538	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GTL3	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GX78	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538		G3V2L1	256 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MEN1	O00255	615 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	OR7A17	O14581	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	FOXS1	O43638	330 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ERLIN1	O75477	346 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	WFS1	O76024	890 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CREB1	P16220	341 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KRT4	P19013	534 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CRHR1	P34998	444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AHR	P35869	848 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HYAL2	Q12891	473 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DOC2A	Q14183	400 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TBCC	Q15814	346 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ASPG	Q86U10	573 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NT5C	Q8TCD5	201 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PHF21B	Q96EK2	531 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HYKK	A2RU49	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TYROBP	O43914	113 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SMIM24	O75264	130 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HBQ1	P09105	142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ARSF	P54793	590 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CHIT1	Q13231	466 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PCLAF	Q15004	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NCF4	Q15080	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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