RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580861.1

LINC00511-210, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00511, Length 467 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-210ENST00000580861 COPG2Q9UBF2 871 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 FITM1A5D6W6 292 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 A8MT66 165 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 E2F3O00716 465 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 HAT1O14929 419 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 WFS1O76024 890 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 WDR47O94967 919 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MED26O95402 600 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DLGAP3O95886 979 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF28P17035 718 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CD22P20273 847 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CASP2P42575 452 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 MAPK10P53779 464 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 REEP5Q00765 189 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 C17orf64Q86WR6 236 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 OR8K5Q8NH50 307 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RDH11Q8TC12 318 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SCYL1Q96KG9 808 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZPBPQ9BS86 351 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 EHD1Q9H4M9 534 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PELI2Q9HAT8 420 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 WWOXQ9NZC7 414 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RARRES3Q9UL19 164 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMCO1Q9UM00 188 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SNX7Q9UNH6 387 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ZZEF1O43149 2961 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 A0A0J9YVX5 310 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 WDR91A4D1P6 747 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 E7EQ34 232 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 H0YGG7 62 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 K7EPI3 171 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 P2RX6O15547 441 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 BPGMP07738 259 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 GFAPP14136 432 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ITGAXP20702 1163 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 RORAP35398 523 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 BCL6P41182 706 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ARL4DP49703 201 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CCR8P51685 355 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ARFIP2P53365 341 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 FOXM1Q08050 763 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 BNIP1Q12981 228 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 CDC16Q13042 620 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00511-210ENST00000580861 STX3Q13277 289 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms