RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	VPS4A	Q9UN37	437 aa		17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		17.78	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT4D	A6NG13	374 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	GABRR3	A8MPY1	467 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	DIRAS1	O95057	198 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	NR4A1	P22736	598 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	CD97	P48960	835 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	CLCA4	Q14CN2	919 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	COQ8B	Q96D53	544 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	MED8	Q96G25	268 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	TPD52L3	Q96J77	140 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	FOPNL	Q96NB1	174 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	CHST8	Q9H2A9	424 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		17.77	■□□□□ 0.44
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf226	A1L170	272 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FUOM	A2VDF0	154 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	KRT87P	A6NCN2	255 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	OR2AG2	A6NM03	316 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATG13	O75143	517 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CD6	P30203	668 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PCGF2	P35227	344 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	KCNC4	Q03721	635 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1A4	Q13733	1029 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF284	Q2VY69	593 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZVL8	140 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT10	Q86SR1	603 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM25	Q86YD3	366 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NAT16	Q8N8M0	369 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	OR56A3	Q8NH54	315 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	REPS1	Q96D71	796 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf34	Q96L11	122 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	DOHH	Q9BU89	302 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ASAH2	Q9NR71	780 aa		17.77	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB9	P28065	219 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CA8	P35219	290 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	BCAP31	P51572	246 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RGN	Q15493	299 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP90	Q8TF47	636 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CAPNS2	Q96L46	248 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	VPS35	Q96QK1	796 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RUBCNL	Q9H714	662 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		17.76	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	YY2	O15391	372 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C1QC	P02747	245 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MT-ND2	P03891	347 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	IMPDH2	P12268	514 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GJA1	P17302	382 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MAP2K4	P45985	399 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ10	P78508	379 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	OR7G3	Q8NG95	312 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR1B	Q92637	280 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN11	A1L157	253 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559		E9PQ18	207 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF197	O14709	1029 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMDEC1	O15204	470 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN6	O43657	245 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	C8A	P07357	584 aa		17.75	■□□□□ 0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms