RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 AHRP35869 848 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 GLRBP48167 497 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSPA7P48741 367 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 HKDC1Q2TB90 917 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT78Q8N1N4 520 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 IP6K3Q96PC2 410 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 RUFY1Q96T51 708 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ADAMTS17-205ENST00000558960 UBXN8O00124 270 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAP2K7O14733 419 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 GFAPP14136 432 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 GMPRP36959 345 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 BCL6P41182 706 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOLR3P41439 243 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCR10P46092 362 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 AVPR1BP47901 424 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 PWP1Q13610 501 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SSPNQ14714 243 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBR1Q16650 682 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDK4Q16654 411 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATG9BQ674R7 924 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 LCA5Q86VQ0 697 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAB43Q86YS6 212 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNX31Q8N9S9 440 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRPV3Q8NET8 790 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTLQ8NG68 377 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTC9Q92623 222 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCYL1Q96KG9 808 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 DRC3Q9H069 523 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 EHD1Q9H4M9 534 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR54Q9H977 334 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 OPTCQ9UBM4 332 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ITPR1Q14643 2758 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 URADA6NGE7 173 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TUBBP07437 444 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SFTPCP11686 197 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ITGAXP20702 1163 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 GCAP28676 217 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCTRP47872 440 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR1D4P47884 311 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 VSNL1P62760 191 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 REEP5Q00765 189 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 OCA2Q04671 838 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 RGS1Q08116 209 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 LAPTM5Q13571 262 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 DEFB109BQ30KR1 87 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 EMBQ6PCB8 327 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ACMSDQ8TDX5 336 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 EXTL1Q92935 676 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 NACC2Q96BF6 587 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SEC16BQ96JE7 1060 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 C10orf90Q96M02 699 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPR78Q96P69 363 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 EPB41L4BQ9H329 900 aa20■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 K7EPI3 171 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 TK2O00142 265 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBLP22087 321 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 GSTM2P28161 218 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SKP1P63208 163 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC9A5Q14940 896 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 PAGE2BQ5JRK9 111 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 UBTD2Q8WUN7 234 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ESAMQ96AP7 390 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 NT5DC2Q9H857 520 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC22A11Q9NSA0 550 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa19.99■□□□□ 0.79
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAU2Q9Y6X3 613 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms