RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 M0R2N6 131 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF208O43345 1280 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 EPHA4P54764 986 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MALLQ13021 153 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK11Q15759 364 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DERL2Q9GZP9 239 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CDH20Q9HBT6 801 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TLCD2A6NGC4 264 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF2O60811 474 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RCBTB2O95199 551 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LINGO3P0C6S8 592 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 BTBD16Q32M84 506 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ASB12Q8WXK4 309 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SFXN2Q96NB2 322 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SERINC2Q96SA4 455 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP26Q9BV47 211 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OSER1Q9NX31 292 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HEY2Q9UBP5 337 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HRGP04196 525 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 BGNP21810 368 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RPS6KA3P51812 740 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 STC1P52823 247 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NFKB2Q00653 900 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ILKQ13418 452 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DTD2Q96FN9 168 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CNBD2Q96M20 576 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GVT2 93 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF14O43557 240 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DDCP20711 480 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MC3RP41968 323 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OR4C6Q8NH72 309 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TANKQ92844 425 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TLR10Q9BXR5 811 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RFXAPO00287 272 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM38O00635 465 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTS3O15072 1205 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF15O94989 841 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 F11P03951 625 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TACSTD2P09758 323 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF8P28908 595 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC15A1P46059 708 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HTR3AP46098 478 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DNASE1L1P49184 302 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HSD11B2P80365 405 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TLR1Q15399 786 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NPY5RQ15761 445 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms