RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF14Q9UBS8 474 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MAST4O15021 2626 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8.2
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHL41O60662 606 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHL18O94889 574 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CELA2AP08217 269 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 IQCKQ8N0W5 287 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 KCT2Q8NC54 265 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMF1Q92530 271 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TM9SF4Q92544 642 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXL8Q96CD0 374 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 AGAP4Q96P64 663 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFATQ9P243 1243 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP10Q9P2G4 905 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 BMP10O95393 424 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 GUCA1CO95843 209 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HEXBP07686 556 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 IL1RNP18510 177 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HIST1H2ADP20671 130 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SAT1P21673 171 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 AP1S2P56377 157 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS2R39P59534 338 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NDUFA9Q16795 377 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 DUPD1Q68J44 220 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PDSS2Q86YH6 399 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 THAP11Q96EK4 314 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 DPH5Q9H2P9 285 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC7O00311 574 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 RAD51CO43502 376 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF224P0DH78 156 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CCND1P24385 295 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ASPGQ86U10 573 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP97Q8IW35 865 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MOCOSQ96EN8 888 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 OR2W5A6NFC9 320 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 H0YIG0 161 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SGK494L7N484 410 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA7AO75326 666 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PRR35P0CG20 571 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 AVPR1BP47901 424 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf54Q08AI8 447 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PCOLCEQ15113 449 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM205Q6UW68 189 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS50Q96JG6 964 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-204ENST00000528201 ERP44Q9BS26 406 aa22.66■■□□□ 1.22
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