RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524884.1

BBS1-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-206	ENST00000524884	STAMBP	O95630	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ASGR1	P07306	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MYL2	P10916	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TCF4	P15884	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CRABP2	P29373	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	HOXC8	P31273	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CPA2	P48052	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PCP4	P48539	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	GEM	P55040	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KCNJ2	P63252	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	BST1	Q10588	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	DPYS	Q14117	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	E2F5	Q15329	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KLC3	Q6P597	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	RBBP8	Q99708	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	EVPL	Q92817	2033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MGAM	O43451	1857 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884		A0A1W2PPM1	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	HAS3	O00219	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PLIN3	O60664	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PEX11A	O75192	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PROP1	O75360	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	TADA2A	O75478	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CABYR	O75952	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	C1QL1	O75973	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	NEBL	O76041	1014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	WDR47	O94967	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS1-206	ENST00000524884	CER1	O95813	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms