RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512331.5

RUFY3-210, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene RUFY3, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-210ENST00000512331 IFT27Q9BW83 186 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 NACA2Q9H009 215 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 CENPHQ9H3R5 247 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 PDE7BQ9NP56 450 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 GKN1Q9NS71 199 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 STK39Q9UEW8 545 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RUFY3-210ENST00000512331 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 F5H5T6 163 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 H7C0S8 307 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MASP2O00187 686 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CCL16O15467 120 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 OLFM2O95897 454 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GLUD1P00367 558 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KLKB1P03952 638 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HLA-DQB2P05538 268 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CA3P07451 260 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MYZAPP0CAP1 466 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GJA1P17302 382 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GABRR2P28476 465 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GCAP28676 217 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SSTR1P30872 391 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 IDUAP35475 653 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ELK3P41970 407 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MAGEA3P43357 314 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 AVPR1BP47901 424 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LMAN1P49257 510 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 NUMBP49757 651 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CLCN4P51793 760 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GPX6P59796 221 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 COG7P83436 770 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TUBA3CQ13748 450 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RPE65Q16518 533 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 C5orf22Q49AR2 442 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TXNDC8Q6A555 127 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LRRC31Q6UY01 552 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 C4orf22Q6V702 233 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GPAT4Q86UL3 456 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LGI2Q8N0V4 545 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PDIK1LQ8N165 341 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TLCD1Q96CP7 247 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HMCESQ96FZ2 354 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CFAP36Q96G28 342 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TTC25Q96NG3 672 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 AGAP3Q96P47 875 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TSGA13Q96PP4 275 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 IL12RB2Q99665 862 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GBA3Q9H227 469 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM51Q9NW97 253 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 NLKQ9UBE8 527 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MAFFQ9ULX9 164 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ICKQ9UPZ9 632 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PLXNA2O75051 1894 aa6.39□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 A0A1W2PQF6 199 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 A8MZ25 164 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 J3KR12 359 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RASGRF2O14827 1237 aa6.38□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MATN3O15232 486 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms