RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	TLR4	O00206	839 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MT-ND2	P03891	347 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GNAO1	P09471	354 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OXTR	P30559	389 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CRISP3	P54108	245 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2P3	Q13401	168 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLC9A5	Q14940	896 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RTL4	Q6ZR62	310 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IQCH	Q86VS3	1027 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RELT	Q969Z4	430 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	POLE4	Q9NR33	117 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RNF6	Q9Y252	685 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEB3	O15480	346 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GPR39	O43194	453 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	B4GAT1	O43505	415 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MMP20	O60882	483 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TYR	P14679	529 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VIPR1	P32241	457 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OR2B6	P58173	313 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PON2	Q15165	354 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ATG9B	Q674R7	924 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL35	Q6PF15	583 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RNF130	Q86XS8	419 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RFK	Q969G6	155 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMCO6	Q96DC7	493 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TJP1	Q07157	1748 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC72	A6NJI9	287 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193		H0YJX3	145 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GNB5	O14775	395 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CHST10	O43529	356 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RASGRP1	O95267	797 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VIP	P01282	170 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	S100A1	P23297	94 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CMPK1	P30085	196 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HMGCL	P35914	325 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLC15A1	P46059	708 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BEND5	Q7L4P6	421 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT13	Q86X67	352 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NUS1	Q96E22	293 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193		A0A096LPI6	279 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM92A	A1XBS5	289 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HMX2	A2RU54	273 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BTN3A3	O00478	584 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OAZ2	O95190	189 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	APOD	P05090	189 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-E	P13747	358 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GPX3	P22352	226 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GJA5	P36382	358 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RORC	P51449	518 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMBIM6	P55061	237 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LMAN2	Q12907	356 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LRP8	Q14114	963 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KANK2	Q63ZY3	851 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM171B	Q6P995	826 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FRS2	Q8WU20	508 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TDP1	Q9NUW8	608 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SNX7	Q9UNH6	387 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GLOD5	A6NK44	160 aa		7.8	□□□□□ -1.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms