RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 GPR143P51810 404 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MFAP4P55083 255 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ASIC1P78348 528 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PDE1BQ01064 536 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CDC16Q13042 620 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC39A14Q15043 492 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CCDC96Q2M329 555 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM198Q66K66 360 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 C18orf63Q68DL7 685 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TAGAPQ8N103 731 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMTC2Q8N394 836 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 OR5R1Q8NH85 324 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 THAP6Q8TBB0 222 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 HM13Q8TCT9 377 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 FIG4Q92562 907 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM19Q96HH6 336 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 FEM1CQ96JP0 617 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PCYT2Q99447 389 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 P2RY13Q9BPV8 354 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM245Q9H330 911 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PXMP2Q9NR77 195 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MALT1Q9UDY8 824 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 VDAC3Q9Y277 283 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 JMJD1CQ15652 2540 aa3.4□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MYH4Q9Y623 1939 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 A0A1W2PR77 199 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 OR2A25A4D2G3 310 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 LILRA5A6NI73 299 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MAP2K7O14733 419 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ANKRD28O15084 1053 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 BEST1O76090 585 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF432O94892 652 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TUBBP07437 444 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 KRT7P08729 469 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MSH2P43246 934 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC15A1P46059 708 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CLDN20P56880 219 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SNX16P57768 344 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC20A2Q08357 652 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SPOCK1Q08629 439 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 STK4Q13043 487 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ZBTB17Q13105 803 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TOMM20Q15388 145 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MYLK3Q32MK0 819 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TRNP1Q6NT89 227 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 GFRALQ6UXV0 394 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM219Q86XT9 240 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 POC5Q8NA72 575 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PIGTQ969N2 578 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MOAP1Q96BY2 351 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 QRFPRQ96P65 431 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 DUX5Q96PT3 197 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TEX12Q9BXU0 123 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 EBF2Q9HAK2 575 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MARCH5Q9NX47 278 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PADI1Q9ULC6 663 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PTPRCP08575 1304 aa3.39□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.38□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TOPBP1-208ENST00000511439 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms