RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINA12Q8IW75 414 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM99Q8N816 258 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 PROX1Q92786 737 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 COQ10BQ9H8M1 238 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 PIGVQ9NUD9 493 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 H0YCG3 227 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 AP3B1O00203 1094 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CXCL11O14625 94 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CTDSPLO15194 276 aa2.12□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 SFTPBP07988 381 aa2.12□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 MAKP20794 623 aa2.12□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A14Q15043 492 aa2.12□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 FIG4Q92562 907 aa2.12□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF510Q9Y2H8 683 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LOXL2Q9Y4K0 774 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LTN1O94822 1766 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TTC21AQ8NDW8 1320 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 KIF20BQ96Q89 1820 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.12□□□□□ -2.07
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