RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	DNA2	P51530	1060 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MYL7	Q01449	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SP3	Q02447	781 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ABR	Q12979	859 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	RAPH1	Q70E73	1250 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	AMER3	Q8N944	861 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	OR2T11	Q8NH01	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MGARP	Q8TDB4	240 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	THAP2	Q9H0W7	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CUEDC2	Q9H467	287 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ITM2B	Q9Y287	266 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A0B4J203	849 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ACSL4	O60488	711 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ATP9A	O75110	1047 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	EML2	O95834	649 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CLPTM1	O96005	669 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	UMOD	P07911	640 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	HMBS	P08397	361 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GOT1	P17174	413 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MAGEB1	P43366	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	HILS1	P60008	231 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	UBXN1	Q04323	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CETN1	Q12798	172 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	CNBD1	Q8NA66	436 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM58	Q8NG06	486 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	OR1L3	Q8NH93	324 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SNX21	Q969T3	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	C10orf90	Q96M02	699 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TSSK2	Q96PF2	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTC21B-208	ENST00000497425	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	GLCE	O94923	617 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	SBK2	P0C263	348 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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