RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494422.1

BRD9-211, Transcript of bromodomain containing 9, humanhuman

TSL 3

Gene BRD9, Length 449 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9-211ENST00000494422 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 EFCAB7A8K855 629 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 E7EQ34 232 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 G3V2L1 256 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 H0YIV9 168 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 DLX3O60479 287 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 NPHS1O60500 1241 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SUPT7LO94864 414 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CLDN9O95484 217 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SBK3P0C264 359 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 MPSTP25325 297 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PIK3CBP42338 1070 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ETV4P43268 484 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SEPHS1P49903 392 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CCNG1P51959 295 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PGGT1BP53609 377 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CSNK1G2P78368 415 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 REEP5Q00765 189 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CLCQ05315 142 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 RGS1Q08116 209 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TGM3Q08188 693 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 LCP2Q13094 533 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CHIT1Q13231 466 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TUBB3Q13509 450 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 FAM53BQ14153 422 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CFAP157Q5JU67 520 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ADCK2Q7Z695 626 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 FAM129CQ86XR2 697 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TEX9Q8N6V9 391 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 BMPERQ8N8U9 685 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SNX31Q8N9S9 440 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 NEIL2Q969S2 332 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PYCR2Q96C36 320 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PHF21BQ96EK2 531 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 OR4K3Q96R72 315 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZNF382Q96SR6 550 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CCT7Q99832 543 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CENPKQ9BS16 269 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CEP250Q9BV73 2442 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 IPPKQ9H8X2 491 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZNF358Q9NW07 568 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 KLHL3Q9UH77 587 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PCTPQ9UKL6 214 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 EMCNQ9ULC0 261 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 WASF3Q9UPY6 502 aa6.12□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 PCM1Q15154 2024 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMEM120BA0PK00 339 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 SERTM1A2A2V5 107 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 A8MU76 341 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMEM114B3SHH9 223 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 H7BY64 318 aa6.11□□□□□ -1.43
BRD9-211ENST00000494422 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms