RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493706.1

XRCC5-210, Transcript of X-ray repair cross complementing 5, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC5, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5-210ENST00000493706 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 DEFB123Q8N688 67 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 OCC1Q8TAD7 63 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 NSMAFQ92636 917 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PROX1Q92786 737 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RMDN2Q96LZ7 410 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 DUX3Q96PT4 197 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 EGFL8Q99944 293 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PIGQQ9BRB3 760 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KIF15Q9NS87 1388 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KIF27Q86VH2 1401 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ARHGEF5Q12774 1597 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ARID2Q68CP9 1835 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.07□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 HFM1A2PYH4 1435 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 MSGN1A6NI15 193 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 CCL24O00175 119 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 AP2A2O94973 939 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GBAP04062 536 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SCG2P13521 617 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ALDH1B1P30837 517 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GP5P40197 560 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PRKCIP41743 596 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 MAGEA11P43364 429 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ALDH3A2P51648 485 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KLC1Q07866 573 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PHKG1Q16816 387 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 XKR6Q5GH73 641 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 LRR1Q96L50 414 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 FN3KQ9H479 309 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.06□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SBF1O95248 1867 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KNDC1Q76NI1 1749 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 A0A087X002 238 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 FAM86B1E9PN63 330 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 KLF11O14901 512 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SNX3O60493 162 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PRAF2O60831 178 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ZG16O60844 167 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RPS6KA5O75582 802 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 RAF1P04049 648 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 HMBSP08397 361 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 FAM86B2P0C5J1 330 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 LHCGRP22888 699 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PSMA3P25788 255 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 HOXC13P31276 330 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 HSD17B3P37058 310 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 MTCP1P56278 107 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PTENP60484 403 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 EXT1Q16394 746 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 PTGISQ16647 500 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 SUSD4Q5VX71 490 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 OR4A47Q6IF82 309 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ZNF790Q6PG37 636 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.05□□□□□ -1.92
XRCC5-210ENST00000493706 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.05□□□□□ -1.92
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