RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF749	O43361	778 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC28A2	O43868	658 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR2B3	O76000	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CPA3	P15088	417 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	AGXT	P21549	392 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IMPA1	P29218	277 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARRB2	P32121	409 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GABRA4	P48169	554 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	AGTR2	P50052	363 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZIC1	Q15915	447 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	EXT2	Q93063	718 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PKP4	Q99569	1192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NLN	Q9BYT8	704 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPTA1	P02549	2419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554		C9J4A7	227 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	BIRC5	O15392	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SUV39H1	O43463	412 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SUPT3H	O75486	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC16A8	O95907	504 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FURIN	P09958	794 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYL2	P10916	166 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GGT5	P36269	586 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC6A12	P48065	614 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRKAA2	P54646	552 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	AP1S2	P56377	157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAJB13	P59910	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF480	Q8WV37	535 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ESAM	Q96AP7	390 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXL8	Q96CD0	374 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL17F	Q96PD4	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PPV9	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554		H3BMH7	237 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	STX16	O14662	325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GUCA1C	O95843	209 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CAPN1	P07384	714 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CD63	P08962	238 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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