RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRPV3Q8NET8 790 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 METTL6Q8TCB7 284 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMEM74Q96NL1 305 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SORT1Q99523 831 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 DPH7Q9BTV6 452 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZMYND15Q9H091 742 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GMNCA6NCL1 334 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 H7BY64 318 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC9O14530 226 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ITM2AO43736 263 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ULK1O75385 1050 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR4F21O95013 312 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CHRNGP07510 517 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PSMB5P28074 263 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARFIP1P53367 373 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HSD11B2P80365 405 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 IFT88Q13099 833 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SPIDRQ14159 915 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AMZ1Q400G9 498 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KANK2Q63ZY3 851 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FRG2Q64ET8 278 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TGM7Q96PF1 710 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FRG2BQ96QU4 278 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RHBGQ9H310 441 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BRF2Q9HAW0 419 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PDE7BQ9NP56 450 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF225Q9UK10 706 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BTRCQ9Y297 605 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KNL1Q8NG31 2342 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQM1 296 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 D6RAR5 112 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 J3QKU1 62 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HDAC3O15379 428 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 VPS4BO75351 444 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RASSF9O75901 435 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CAPN1P07384 714 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MAGP20916 626 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SCTRP47872 440 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARL4DP49703 201 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GNGT1P63211 74 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CES4AQ5XG92 561 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RNF44Q7L0R7 432 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ADCK2Q7Z695 626 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF781Q8N8C0 355 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR7G3Q8NG95 312 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR8K5Q8NH50 307 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CCT6BQ92526 530 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NXPE2Q96DL1 559 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K3Q99759 626 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms