RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 RHDQ02161 417 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ACAP2Q15057 778 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PCSK4Q6UW60 755 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 COX15Q7KZN9 410 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TCFL5Q9UL49 500 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.25■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC14CA4D256 554 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 VARSP26640 1264 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 GRK3P35626 688 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 AGTR2P50052 363 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC16Q13042 620 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MUM1Q2TAK8 710 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 NXPE4Q6UWF7 544 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SYVN1Q86TM6 617 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MFSD9Q8NBP5 474 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PELI2Q9HAT8 420 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC11Q9NVH1 559 aa25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 OR1F1O43749 312 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 RFPL1O75677 317 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 STK16O75716 305 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 REEP5Q00765 189 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TBR1Q16650 682 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TM4SF19Q96DZ7 209 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 THAP11Q96EK4 314 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SARGQ9BW04 601 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 FETUBQ9UGM5 382 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PCSK5Q92824 1860 aa25.23■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TRBC2A0A5B9 178 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 NUDT17P0C025 328 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 EMP3P54852 163 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 DEFB109BQ30KR1 87 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 LGSNQ5TDP6 509 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 KLC3Q6P597 504 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX31Q8N9S9 440 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf62Q9BQA9 187 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CD244Q9BZW8 370 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TBK1Q9UHD2 729 aa25.22■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SYCE1LA8MT33 242 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PRAMEF4O60810 478 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ONECUT2O95948 504 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 GNAZP19086 355 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 LINC00303Q3SY05 128 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ASPGQ86U10 573 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MTBPQ96DY7 904 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MOCOSQ96EN8 888 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC77Q9BR77 488 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CTSFQ9UBX1 484 aa25.21■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 TXNDC9O14530 226 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP2K7O14733 419 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXS1O43638 330 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 EPORP19235 508 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SCTRP47872 440 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 UGT8Q16880 541 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 GARNL3Q5VVW2 1013 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD53Q8N9V6 530 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 KCT2Q8NC54 265 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 UBTD2Q8WUN7 234 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC13A3Q8WWT9 602 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 AIF1LQ9BQI0 150 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM117AQ9C073 453 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 XPR1Q9UBH6 696 aa25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
GTF3C4-202ENST00000483873 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC189A1A4V9 331 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 RECKO95980 971 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGB2P05107 769 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 GFAPP14136 432 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SLCO1A2P46721 670 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PDK4Q16654 411 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PFKFB4Q16877 469 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CAMKVQ8NCB2 501 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms